Hamilelik sırasında mikrodalga fırın kullanmak, yakınında bulunmak veya mikrodalga fırında pişirilen yiyecekleri yemek sakıncalı değildir. Bu fırınları kullanan hamilelerde gelişen herhangi bir yan etki gösterilmemiştir.
Mikrodalga fırınlar non-iyonize mikrodalga radyasyon aracılığıyla yiyecekleri ısıtırlar. Bu mikrodalga radyasyon yiyecek ve içecekler içerisinde absorbe olarak ısı enerjsine dönüşür bu nedenle besin için radyasyon oluşması gibi bir durum sözkonusu değildir. Ayrıca mikrodalga fırınlarda non-iyonize rasyasyon bulunduğundan röntgen ışınlarındaki iyonize radyasyon gibi kanser etkisi v.b zararlı etkileri yoktur. Zaten günümüzde üretilen mikrodalga fırınlar çok az radyasyon enerjisi üretirler.